用直通卡和直接用主板上的SATA接口有什么区别？

主板自带的SATA口是南桥提供的，所以这个SATA口和usb3.0，部分m2接口，网络接口，音频等等共享CPU到南桥的带宽。
不同主板的总线带宽不同，性能也就有些区别。老一些intel主板，CPU到pch芯片的dmi总线相当于pcieX4的带宽，这时有个m2接口也走南桥那就真的捉襟见肘了。
不过南桥SATA的好处是兼容性都很好，也能支持休眠省电等特性，功耗也不高。直通卡一般是指sas接口的it模式HBA卡，一般采用pciex8接口，这种卡自带CPU，还有一定的片内缓存，两点好处，一是支持sas协议的硬盘，二手的sas盘一般比SATA盘便宜。二是，芯片带CPU，对系统资源的占用很低。不过这种卡都有五瓦到十几瓦的功耗，怎么都比南桥费电一些。它还有个好处是可以通过pcie槽直连CPU的pcie通道，可以解决南桥总线大家抢带宽的问题，最大带宽会更好一些。
当然，最终选择哪种方式，还是得自己根据需要去选择的。